После 1966 г. обстановка на транспорте еще более усложнилась, его неспособность удовлетворить потребности народного хозяйства с каждым днем становилась все более очевидной
В 1965 г. 1/10 находившихся в эксплуатации железных дорог использовалась на 80% их проектной мощности. Учитывая продолжающийся рост грузооборота и длительность сроков реконструкции железных дорог, следовало вплотную заняться их реконструкцией, однако все силы отнимало новое строительство. На цели реконструкции в первую пятилетку было израсходовано 24,8% средств, ассигнованных на железнодорожное строительство, во вторую пятилетку - 36,1 в 1963-1965 гг. - 19,4, в третью и четвертую пятилетки - около 10, в 1976-1978 гг. - 30%.
На водном транспорте отставание портового хозяйства стало очевидным в 1965 г., однако продолжался упор на расширение флота судов. Доля ассигнований на сооружение портов в общих капиталовложениях составляла в период первой пятилетки 0,4%, во время второй - 0,3, в 1963-1972 гг. - 0,2, в 1973 г. - 0,6, в 1974-1976 гг. - более 1 %.
Однако отставание как железнодорожного, так и водного транспорта преодолеть не удалось. Доля железных дорог с коэффициентом использования свыше 80 выросла с 10% в 1965 г. до 30% в 1978 г. Из-за плохого оборудования портов иностранные суда разгружались медленно, в 1978 г. из-за задержки судов был выплачен штраф в размере более 80 млн. долл., что равно 2/5 ассигнований на портовое строительство. В 1979 г. потери достигли уже 100 млн. долл. Расходы на фрахт иностранных судов составили такую сумму, которой было бы достаточно для покупки судов общим водоизмещением 600 тыс. т.